DNA合成儀有不同的類型，包括實驗室型、工業型和大規模合成型。實驗室型合成儀主要用于生物實驗室中，而工業型合成儀主要用于大型生物實驗室以及商業機構中。大規模合成司則主要用于生物醫藥原料藥制備領域，可以進行規模化量產。
用于和DNA或RNA結構類似的寡核苷酸合成的自動化儀器，即是DNA合成儀。通常用于固相合成法，每次在長的寡核苷酸鏈上接入一個核苷酸。加入每一個核苷酸均通過相同的化學反應和相應的**或嘧啶堿基衍生物作用。儀器不同，所用化學反應和操作細節也會隨之發生變化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了廣泛的應用。
DNA合成儀一般需堿基瓶組及試劑瓶組。試劑瓶組一般最少為6個，含脫保護劑（Deb）、活化劑（act）、蓋帽試劑A（capA）、蓋帽試劑B(capB)、氧化劑（OXI）及洗脫乙腈（ACN），每種儀器一般都多設置1-2個試劑瓶位，用于特殊產物的合成。堿基瓶組一般最少為4個標準堿基（A/C/G/T）,同時搭配2-多個特殊堿基瓶位，用于熒光標記等合成。
DNA 合成儀采用一定壓力的惰性氣體(氬氣)或氮氣及電磁閥組驅動液體試劑，也可采用氦氣驅動試劑。某些合成儀采用slider block滑塊系統及精密蠕動泵，可不采用氣體為驅動系統。采用氣體及電磁閥驅動液體試劑時，需先將管路系統電磁閥前段，含試劑瓶組中壓力加壓到規定氣壓，通過合成管理軟件或手動打開電磁閥(一般打開時間為數ms)，即可驅動液體試劑到所需的合成柱中。
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